Les hybrides sont très rares dans la nature. Si l'hybridation est facile, les espèces auraient tendance à se mélanger jusqu'à n'en former qu'une seule. Dans la pratique plusieurs trucs empéchent l'apparition d'un grand nombre d'hybrides: comportements, biotops ou zones géographiques différents. Par exemple, certains hybrides de papillons obtenus artificiellement ne peuvent exister dans la nature car leurs parents ne se reproduisent pas à la même époque de l'année. Le lion et le léopard, bien que hybridables et partageant le même territoire ont des comportements complétement différents: l'un est terrestre et vit en harems alors que l'autre est arboricole et vit en solitaire. Des mécanismes génétiques empéchent également l'apparition d'hybrides: plusieurs espèces de tritons peuvent s'hybrider, mais l'hybride mâle est stérile tandis que l'hybride femelle donne naissance à des individus de l'une des espèces, en fonction de l'ADN du père. Ainsi le triton crêté et le triton marbré peuvent facilement s'hybrider et cohabitent dans les mêmes zones géographiques. Néanmoins, si un triton marbré rentre dans une mare habitée par des tritons crêtés, ses descendants seront essentiellement des tritons crêtés: ses gènes sont dilués. Ainsi même si la cohabitation est possible, elle tend à faire disparaître l'espèce la moins représentée localement: chaque mare n'est habitée à long terme que par une seule espèce.