Phylogenetic relationships

Posté par Para il y a 18 ans

Ce genre de document et de matrice me fait tjs flipper
http://www.peabody.yale.edu/scipubs/pdfs/Chiappe.pdf

Si vous voulez jouer avec essayer le logiciel libre PAST

http://folk.uio.no/ohammer/past/

et armez vous de patience

Posté par Carcharo il y a 18 ans

Comment t'utilise past?

Posté par Para il y a 18 ans

Y a la doc sur le site

Posté par Markvantomme il y a 18 ans

En general on utilise pas ce logiciel,jamais entendu parler meme
Le plus souvant (pour dinos) c'est soit Paup, MacClade et Nona, ce dernier est gratos.
Une matrice telle qu'elle se presente dans un article n'est pas utilisable,il faut copier coller le texte dans le bloc de notes e ensuite ajouter les commandes, dans le cas de Paup, les "Paup blocks" , on definit le ou les outgroups, le type de recherche (heuristique, branch and bound, exhaustive), si un character doit peser plus, si on veut en transformation accelérée (Actran) ou lente (Deltran), si on veut qu'il montre la "consensus tree" à la fin etc etc, c'est plus facile de faire tout ça avec Nexus qui edite ce type de fichiers.
J'ai téléchargé la matrice de Martill & Naish 2006 sur pteros,j'ai deja tout mis dedans, il suffit d'executer le fichier que tout se fait tout seul



http://download.yousendit.com/4ED573E30F0D6749